В целях реализации важных направлений деятельности ТИНРО, функционируют следующие обособленные структурные подразделения:

ЧукотТИНРО: Отдел научных исследований биоресурсов внутренних водоёмов и вод, прилегающих к Чукотскому АО Тихоокеанского филиала ФГБНУ «ВНИРО» («ТИНРО»);

Инновационный научно-производственный центр марикультуры на о. Попова;

Станция "Научно-исследовательская рыбоводная в пос.Лучегорск";

Станция "Континентальная научно-исследовательская в пос.Камень-Рыболов";

Наблюдательный пункт в пос.Ольга Континентальной НИС;

Станция "Лазовская научно-исследовательская в пос. Заповедный" отдела технического обеспечения аквакультуры;

Научно-исследовательская станция (НИС) "Де-Ливрона";

Научно-исследовательская станция "Океаническая" в селе Крабозаводское о. Шикотан.